Research Software Engineer Rotterdam Advanced Respiratory Care research group

Functie inhoud

Raak jij enthousiast over het omzetten van complexe respiratoire data en analyses van de Intensive Care naar open, FAIR software die onderzoek naar een hoger niveau tilt? Sluit je dan aan bij de Rotterdam Advanced Respiratory Care (ROTARC) groep en help mee aan de ontwikkeling van een nationale digitale infrastructuur voor de volgende generatie respiratoire wetenschap. 

Je werkt mee aan de ontwikkeling van M3Resp. Dit is een nieuw open-source FAIR platform voor multimodale monitoring van respiratoire signalen op de IC, waaronder oppervlakte-EMG (sEMG), elektrische impedantietomografie (EIT), signalen van de kunstmatige beademing en ademhalingsspierdrukken. Dit project is een nauwe samenwerking tussen de Universiteit Twente (CRPH - Cardiovascular and Respiratory Physiology groep, sEMG expertisecentrum) en de afdeling Intensive Care van het Erasmus MC (ROTARC - Rotterdam Advanced Respiratory Care groep, EIT expertisecentrum), 2 internationaal toonaangevende instituten op het gebied van respiratoir en beademingsonderzoek.

Open Science NL financiert open, herbruikbare en door de community gedreven research software. Beide instellingen bieden een voltijdse functie aan voor een periode van 1 jaar. Je werkt nauw samen met de Research Software Engineer van Universiteit Twente en met onderzoekers in beide instellingen om een ​​duurzame nationale digitale onderzoeksinfrastructuur op te bouwen. 

Door 2 bestaande research softwarepakketten (ALIVE en ReSurfEMG) te integreren en uit te breiden, maak je uniforme data- en signaalverwerking en gebruiksvriendelijke GUI-gebaseerde analyses mogelijk voor klinisch en fysiologisch onderzoek. Je combineert softwareontwikkeling in Python, biomedische signaalverwerking en FAIR data principes en draagt ​​bij aan een platform dat onderzoekers ondersteunt bij het begrijpen en analyseren van complexe respiratoire data. Je voegt codebases samen, implementeert specifieke datacontainers, optimaliseert signaalverwerkingsalgoritmen, bouwt een Dash-gebaseerde GUI en ontwikkelt gestandaardiseerde analyse-pipelines.

De functie omvat ook community-gerichte taken zoals het ontwikkelen van documentatie, tutorials en gebruikerssupport. Sterke programmeervaardigheden, ervaring met time-series data en interesse in biomedische signalen en open-source research software zijn vereist.

Werkomgeving

Je maakt deel uit van onze Rotterdam Advanced Respiratory Care (ROTARC) onderzoeksgroep (10 tot 15 onderzoekers), bestaande uit intensivisten, arts-onderzoekers, technisch geneeskundigen, ventilation practitioners en datawetenschappers. Het is onze ambitie om gepersonaliseerde beademingsondersteuning voor de kritisch zieke patiënt te optimaliseren door innovatief gebruik van (nieuwe) technologie. 

We stimuleren fysiologisch onderzoek en hanteren een datagedreven open science en open softwarebenadering, gericht op het verbeteren van de patiëntenzorg. Je werkt ook nauw samen met de Universiteit Twente (CRPH - Cardiovascular and Respiratory Physiology groep) en de Research Software Engineer die voor dit M3Resp-project aldaar wordt aangenomen.

Profiel

• Een PhD (of een gelijkwaardige ervaring in research software engineering) in Biomedische Technologie, Technische Geneeskunde, Informatica, Toegepaste Natuurkunde of een verwant vakgebied.
• Sterke software engineering vaardigheden in Python, inclusief ervaring met Git, framework design en het publiceren van software; ervaring met Dash of andere GUI-frameworks is een pluspunt.
• Ervaring met signaalverwerking en time-series data analyse, bij voorkeur inclusief sEMG of EIT.
• Affiniteit met FAIR dataprincipes en open-source softwareontwikkeling.
• Uitstekende communicatieve vaardigheden, een samenwerkingsgerichte houding en veel aandacht voor documentatie en gebruikersondersteuning.
• Goede beheersing van de Engelse taal.

Bekijk hier de voorwaarden voor indiensttreding bij Erasmus MC.

Wat bieden wij

• Een tijdelijk contract voor 12 maanden.
• Een bruto maandelijks salaris van €4.818,- (salarisschaal 10 trede 7) gebaseerd op een fulltime dienstverband van 36 uur.
• Een 13e maand die we in november uitkeren en een persoonlijk reiskostenbudget.
• Een pensioenverzekering bij het ABP. Wij betalen 70% van je pensioenpremie waardoor je netto salaris hoger uitvalt dan je misschien denkt. 

En wist je dat we een inhouse sportschool en fietsenmaker hebben?

Alle arbeidsvoorwaarden zijn conform de cao Universitair Medische Centra.

Meer informatie

Maak van deze vacature jouw nieuwe baan. Solliciteer nu via de sollicitatiebutton en voeg je cv, motivatiebrief en publicatielijst toe. 

Inhoudelijke vragen over deze vacature? Neem dan gerust contact op met Annemijn Jonkman, assistant professor, a.jonkman@erasmusmc.nl.

Acquisitie naar aanleiding van deze advertentie is niet gewenst.