PhD candidate on the project AI PRECISE

Functie inhoud

Een nauwkeurige risicostratificatie bij hoog-risico niet-spierinvasieve blaaskanker (HR-NMIBC) blijft een uitdaging. Dit leidt vaak tot onder- of overbehandeling. Gepersonaliseerde, blaas besparende therapieën zijn momenteel niet beschikbaar, waardoor patiënten vaak een ingrijpende blaas verwijdering ondergaan met grote impact op hun kwaliteit van leven. RNA-gebaseerde moleculaire subtypes kunnen mogelijk bijdragen aan betere risicostratificatie, maar worden in de kliniek nog weinig toegepast vanwege hoge kosten en lange verwerkingstijden.

In dit promotieonderzoek ontwikkel je innovatieve AI-methoden die histopathologische beelden combineren met RNA-sequencingdata om moleculaire subtypes van blaaskanker te voorspellen. Het uiteindelijke doel is het identificeren van nieuwe therapeutische aangrijpingspunten, die gevalideerd worden met behulp van blaaskanker-organoïden. Jij wordt de eerste die betrouwbare en uitgebreide AI-modellen ontwikkelt voor subtypevoorspelling, met directe impact op klinische besluitvorming en gepersonaliseerde behandelstrategieën.

Dit project, gefinancierd door NWO, bouwt voort op het Europese CLARIFY-project en wordt uitgevoerd in samenwerking met een postdoc, een promovendus en een lab technicus. Je werkt nauw samen met clinici om klinisch relevante onderzoeksvragen te formuleren, pathologiedata te digitaliseren en je richt je primair op medische beeldanalyse en AI-ontwikkeling.

Het project is een samenwerking tussen het Radboudumc, ProBCI (Dutch Bladder Cancer Infrastructure) en IKNL (Integraal Kankercentrum Nederland). De functie start in het vierde kwartaal van 2025, uiterlijk in januari 2026.

Werkomgeving

Je onderzoek vindt plaats binnen de afdelingen Urologie, Pathologie en Klinische Bio-informatica van het Erasmus MC in Rotterdam, in nauwe samenwerking met de Computational Pathology Group van het Radboudumc in Nijmegen. De afdeling Urologie is internationaal toonaangevend op het gebied van blaaskankeronderzoek en -behandeling, met geavanceerde multi-omics en organoïde technologieën. De afdeling Pathologie is gespecialiseerd in klinische bio-informatica en AI-gedreven diagnostiek en prognostiek bij diverse kankersoorten.

Beide afdelingen bieden een inclusieve, samenwerkende en ondersteunende werkomgeving met toegang tot moderne onderzoeksfaciliteiten, waaronder GPU-clusters, dataservers en persoonlijke werkstations met GPU-ondersteuning. Je maakt deel uit van een multidisciplinair team van ervaren onderzoekers op het gebied van beeldanalyse, machine learning, oncologie en pathologie.

Wij selecteren geen kandidaten op basis van kwalificaties en motivatie, ongeacht geslacht, gender, geloof, afkomst of beperking. Je werkt samen met clinici (urologen en pathologen) en onderzoekers met expertise in beeldanalyse, AI, chirurgie en oncologie.

Begeleiding wordt verzorgd door Tahlita Zuiverloon (MD PhD, universitair hoofddocent), Martijn Starmans (PhD, universitair docent), Farhan Akram (PhD, universitair docent) van het Erasmus MC en Geert Litjens (PhD, hoogleraar) van het Radboudumc.

Profiel

• Je bent een zelfstandige, gemotiveerde onderzoeker met een MSc of MEng in Biomedische Technologie, Nano Biologie, Medische Informatica, Klinische/Biomedische Technologie, Informatica, Engineering, Natuurkunde, Wiskunde of een vergelijkbaar vakgebied.
• Uitstekende beheersing van de Engelse taal is vereist.
• Een achtergrond in de biomedische wetenschappen is een pluspunt.
• Ervaring met medische beeldverwerking, histopathologie, computer vision, machine learning en programmeren (bij voorkeur in Python) is zeer gewenst.
• Je kunt effectief communiceren met clinici en onderzoekers uit verschillende disciplines.

Bekijk hier de voorwaarden voor indiensttreding bij Erasmus MC.

Wat bieden wij

• Een tijdelijke positie voor 4 jaar.
• Een bruto maandsalaris begint bij € 3.108,-  en eindigt bij je vierde jaar in € 3.939,- (schaal OIO) bij een volledige werkweek van 36 uur.
• Een 13e maand die we in november uitkeren en een reiskostenvergoeding. Bijvoorbeeld 100% OV-vergoeding bij een enkele reis van minimaal 7 km. 
• Een pensioenverzekering bij het ABP. Wij betalen 70% van je pensioenpremie waardoor je netto salaris hoger uitvalt dan je misschien denkt.
• En wist je dat we een eigen sportschool, fietsenmaker en gratis fysiotherapie hebben? 

Alle arbeidsvoorwaarden zijn conform de cao Universitair Medische Centra.

Meer informatie

Maak van deze vacature jouw nieuwe baan! Solliciteer nu via de sollicitatiebutton. Het begint met doen.

Inhoudelijke vragen over de vacature? Neem contact op met Tahlita Zuiverloon via t.zuiverloon@erasmusmc.nl.

Acquisitie naar aanleiding van deze advertentie is niet gewenst.